З 2002 року, сумісно з АМН та МОЗ України, Інститут видає медичний науково-практичний журнал "Проблеми ендокринної патології" (свідоцтво про державну реєстрацію КВ № 5081 від 11.02.02 р., передплатний індекс 06725). Головний редактор видання - д-р мед. наук, проф. Ю.І. Караченцев.

Журнал, розрахований на широке коло читачів (лікарів, наукових співробітників, викладачів та студентів медичних вузів), щоквартально публікує на своїх сторінках матеріали клінічних досліджень з питань патогенезу, діагностики, лікування та профілактики ендокринних захворювань та супутньої патології; результати експериментальних досліджень; матеріали по розробці, біологічному та клінічному випробуванню нових лікарських засобів; огляди літератури та лекції з актуальних проблем ендокринології.

Журнал внесено до переліку наукових фахових видань ВАК України з медицини та біології (пост. від 27.05.09, № 1-05/2; пост. від 08.07.09, № 1-05/3. Бюл. ВАК України № 8 - 2009), до інформаційної бази ВІНІТІ (Росія).